ဖွဲ့စည်းတည်ဆောက်ပုံသွင်ပြင်လက္ခဏာများနှင့် transmembrane peptides အမျိုးအစားခွဲခြားခြင်း။

transmembrane peptides အမျိုးအစားများစွာရှိပြီး ၎င်းတို့၏ အမျိုးအစားခွဲခြားမှုသည် ရုပ်ပိုင်းဆိုင်ရာနှင့် ဓာတုဂုဏ်သတ္တိများ၊ အရင်းအမြစ်များ၊ စားသုံးမိသော ယန္တရားများနှင့် ဇီဝဆေးပညာဆိုင်ရာ အသုံးချမှုများအပေါ် အခြေခံထားသည်။၎င်းတို့၏ ရုပ်ပိုင်းဆိုင်ရာနှင့် ဓာတုဂုဏ်သတ္တိများ အရ အမြှေးပါးကို ထိုးဖောက်ဝင်ရောက်သည့် peptides များကို cationic၊ amphiphilic နှင့် hydrophobic ဟူ၍ သုံးမျိုး ခွဲခြားနိုင်သည်။Cationic နှင့် amphiphilic အမြှေးပါးကို ထိုးဖောက်ဝင်ရောက်သည့် peptides သည် 85% ရှိပြီး hydrophobic membrane ထိုးဖောက်သည့် peptides သည် 15% သာရှိသည်။

1. Cationic အမြှေးပါးကို ထိုးဖောက်ဝင်ရောက်သော peptide

Cationic transmembrane peptides များသည် TAT၊ Penetratin၊ Polyarginine၊ P22N၊ DPV3 နှင့် DPV6 ကဲ့သို့သော arginine၊ lysine နှင့် histidine ကြွယ်ဝသော တိုတောင်းသော peptides များဖြင့် ဖွဲ့စည်းထားသည်။၎င်းတို့တွင် arginine တွင် ဆဲလ်အမြှေးပါးပေါ်ရှိ ဖော့စဖောရစ်အက်ဆစ်အုပ်စုများနှင့် ဟိုက်ဒရိုဂျင်ကို အနုတ်လက္ခဏာဆောင်သော ဖော့စဖောရစ်အက်ဆစ်အုပ်စုများနှင့် ပေါင်းစပ်နိုင်ပြီး ဇီဝကမ္မ PH တန်ဖိုးအခြေအနေအောက်တွင် အမြှေးပါးထဲသို့ transmembrane peptides များကို ပြေလည်အောင်ဆောင်ရွက်ပေးသည်။oligarginine ၏လေ့လာမှုများ (3 R မှ 12 R) မှ arginine ပမာဏသည် 8 အောက်ရှိမှသာ အမြှေးပါးထိုးဖောက်နိုင်စွမ်းကို အောင်မြင်ပြီး arginine ပမာဏ တိုးလာသည်နှင့်အမျှ အမြှေးပါးထိုးဖောက်နိုင်စွမ်းသည် တဖြည်းဖြည်း တိုးလာကြောင်းပြသခဲ့သည်။Lysine သည် arginine ကဲ့သို့ cationic ဖြစ်သော်လည်း guanidine မပါဝင်သောကြောင့် ၎င်းတွင် တစ်ခုတည်းရှိသောအခါ ၎င်း၏ အမြှေးပါးထိုးဖောက်မှု ထိရောက်မှုမှာ အလွန်မြင့်မားမည်မဟုတ်ပေ။Futaki et al ။(၂၀၀၁) တွင် အပြုသဘောဆောင်သော အမိုင်နိုအက်ဆစ် ၈ မျိုးထက်မနည်း ပါ၀င်သော cationic cell အမြှေးပါးတွင် ထိုးဖောက်ဝင်ရောက်သည့် peptide မှသာလျှင် ကောင်းမွန်သော အမြှေးပါးထိုးဖောက်ခြင်းအကျိုးသက်ရောက်မှုကို ရရှိစေနိုင်ကြောင်း တွေ့ရှိခဲ့သည်။အပြုသဘောဆောင်သော အမိုင်နိုအက်ဆစ်အကြွင်းအကျန်များသည် အမြှေးပါးကိုထိုးဖောက်ဝင်ရောက်ရန် ထိုးဖောက်ဝင်ရောက်နိုင်သော peptides များအတွက် မရှိမဖြစ်လိုအပ်သော်လည်း W14 သည် F အဖြစ်သို့ပြောင်းလဲသောအခါ၊ Penetratin ၏ထိုးဖောက်ဝင်ရောက်နိုင်မှု ဆုံးရှုံးသွားခြင်းကဲ့သို့သော အခြားအမိုင်နိုအက်ဆစ်များသည် ထပ်တူအရေးကြီးပါသည်။

cationic transmembrane peptides ၏ အထူးအတန်းသည် arginine၊ lysine နှင့် proline ကြွယ်ဝသော တိုတောင်းသော peptides များပါ၀င်ပြီး nuclear pore complex မှတဆင့် နျူကလိယသို့ ပို့ဆောင်နိုင်သည်။NLS များကို အခြေခံ အမိုင်နိုအက်ဆစ် အစုအဝေး တစ်ခုနှင့် နှစ်ခု အသီးသီး ပါဝင်သော တစ်ခုတည်း နှင့် နှစ်ချက် ရိုက်ခြင်း ဟူ၍ ထပ်မံ ပိုင်းခြားနိုင်ပါသည်။ဥပမာအားဖြင့်၊ simian virus 40(SV40) မှ PKKKRKV သည် စာရိုက် NLS တစ်ခုတည်းဖြစ်ပြီး၊ နူကလီးယားပရိုတင်းသည် နှစ်ချက်ရိုက် NLS ဖြစ်သည်။KRPAATKKAGQAKKKL သည် အမြှေးပါးကူးပြောင်းမှုတွင် ပါဝင်နိုင်သည့် တိုတောင်းသော sequence ဖြစ်သည်။NLS အများစုတွင် အားသွင်းနံပါတ် 8 ထက်နည်းသောကြောင့် NLS များသည် ထိရောက်သော transmembrane peptides များမဟုတ်သော်လည်း amphiphilic transmembrane peptides များဖွဲ့စည်းရန်အတွက် hydrophobic peptides အစီအစဉ်များနှင့် covalently ချိတ်ဆက်သောအခါတွင် ၎င်းတို့သည် ထိရောက်သော transmembrane peptides များဖြစ်နိုင်ပါသည်။

တည်ဆောက်ပုံ- ၂

2. Amphiphilic transmembrane peptide

Amphiphilic transmembrane peptides တွင် မူလ amphiphilic၊ secondary α-helical amphiphilic၊ β-folding amphiphilic နှင့် prolin-enriched amphiphilic ဟူ၍ ပိုင်းခြားနိုင်သော hydrophilic နှင့် hydrophobic domains များ ပါဝင်သည်။

Primary type amphiphilic wear membrane peptides အမျိုးအစား NLSs နှင့် အမျိုးအစားခွဲဖြစ်သည့် MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) နှင့် Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV) ကဲ့သို့သော hydrophobic peptide အစီအစဉ်ဖြင့် ချိတ်ဆက်ထားသော အမျိုးအစား နှစ်ခုလုံးသည် PKK (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) နှင့် Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV)၊ MPG ၏ဒိုမိန်းသည် HIV glycoprotein 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) ၏ပေါင်းစပ်မှုအစီအစဥ်နှင့် ဆက်စပ်နေပြီး Pep-1 ၏ hydrophobic domain သည် မြင့်မားသောအမြှေးပါးဆက်စပ်မှုရှိသော tryptophan ကြွယ်ဝသောအစုအဝေး (KETWWET WWTEW) နှင့် ဆက်စပ်နေသည်။သို့သော်၊ နှစ်ခုလုံး၏ hydrophobic domains များသည် WSQP မှတဆင့် PKKKRKV signal နှင့် ချိတ်ဆက်ထားသည်။ပင်မ amphiphilic transmembrane peptides ၏နောက်ထပ်အတန်းအစားကို pVEC၊ ARF(1-22) နှင့် BPrPr(1-28) ကဲ့သို့သော သဘာဝပရိုတင်းများမှ ခွဲထုတ်ထားပါသည်။

အလယ်တန်း α-helical amphiphilic transmembrane peptides များသည် α-helices မှတစ်ဆင့် အမြှေးပါးနှင့် ချည်နှောင်ထားပြီး ၎င်းတို့၏ hydrophilic နှင့် hydrophobic amino acid အကြွင်းအကျန်များသည် MAP (KLALKLALK ALKAALKLA) ကဲ့သို့သော helical ဖွဲ့စည်းပုံ၏ မတူညီသောမျက်နှာပြင်များတွင် တည်ရှိပါသည်။beta peptide folding type amphiphilic wear membrane အတွက်၊ ၎င်းသည် beta pleated sheet တစ်ခုဖွဲ့စည်းနိုင်မှုသည် VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) တွင်ကဲ့သို့ အမြှေးပါး၏ထိုးဖောက်နိုင်စွမ်းကို သုတေသနပြုသည့်လုပ်ငန်းစဉ်တွင်၊ VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTGKGDPKPD) တွင်ကဲ့သို့ အမြှေးပါး၏ထိုးဖောက်နိုင်စွမ်းကို သုတေသနပြုရာတွင် အရေးကြီးပါသည်။ - အမိုင်နိုအက်ဆစ် ဗီဇပြောင်းလဲခြင်း analogues များသည် beta folded piece ကိုမဖွဲ့စည်းနိုင်ပါ၊ အမြှေးပါး၏ထိုးဖောက်နိုင်စွမ်းသည် အလွန်ညံ့ဖျင်းပါသည်။ပရိုလိုင်း-ကြွယ်ဝသော amphiphilic transmembrane peptides တွင်၊ ပရိုလိုင်းသည် polypeptide ဖွဲ့စည်းတည်ဆောက်ပုံတွင် အလွန်ကြွယ်ဝသောအခါ သန့်စင်သောရေတွင် polyproline II (PPII) ကို အလွယ်တကူ ဖွဲ့စည်းနိုင်သည်။PPII သည် အလှည့်တစ်ခုလျှင် အမိုင်နိုအက်ဆစ် အကြွင်းအကျန် 3.0 ပါရှိသော ဘယ်သန် helix တစ်ခုဖြစ်ပြီး အလှည့်တစ်ခုလျှင် 3.6 အမိုင်နိုအက်ဆစ် အကြွင်းအကျန်များရှိသော စံညာသန် alpha-helix ဖွဲ့စည်းပုံနှင့် ဆန့်ကျင်ဘက်ဖြစ်သည်။ပရိုလိုင်း-ကြွယ်ဝသော amphiphilic transmembrane peptides များသည် bovine antimicrobial peptide 7(Bac7), synthetic polypeptide (PPR)n(n ဖြစ်နိုင်သည် 3၊ 4၊ 5 နှင့် 6) စသည်တို့ပါဝင်သည်။

တည်ဆောက်ပုံ-၃

3. Hydrophobic အမြှေးပါး peptide ထိုးဖောက်ခြင်း။

Hydrophobic transmembrane peptides တွင် ဝင်ရိုးစွန်းမဟုတ်သော အမိုင်နိုအက်ဆစ်အကြွင်းအကျန်များသာ ပါဝင်ပြီး အမိုင်နိုအက်ဆစ်အစီအစဉ်၏ စုစုပေါင်းတာဝန်ခံ၏ 20% ထက်နည်းသော အသားတင်တာဝန်ခံများ သို့မဟုတ် transmembrane အတွက် မရှိမဖြစ်လိုအပ်သော hydrophobic moieties သို့မဟုတ် ဓာတုအုပ်စုများ ပါဝင်ပါသည်။ဤဆယ်လူလာ transmembrane peptides များကို မကြာခဏ လျစ်လျူရှုထားသော်လည်း၊ Kaposi's sarcoma မှ fibroblast Growth factor (K-FGF) နှင့် fibroblast growth factor 12 (F-GF12) ကဲ့သို့သော ၎င်းတို့သည် ရှိနေပါသည်။


စာတိုက်အချိန်- မတ်လ ၁၉-၂၀၂၃